APAF1（apoptotic peptidase activating factor 1）はアポトーシスに関与するタンパク質で、線虫Caenorhabditis elegansのCED-4のヒトホモログである。
機能
APAF1遺伝子は、アポトーシス調節ネットワークの中心的なハブの1つを形成する細胞質タンパク質をコードする。APAF1タンパク質は（N末端から）CARDドメイン、ATPアーゼドメイン（NB-ARC）、短いヘリカルドメイン、そして数個のWD40リピートドメインを含む。シトクロムcとdATPの結合に伴って、オリゴマーからなるアポトソームを形成する。アポトソームはカスパーゼ-9前駆体を結合して切断し、成熟した活性化型として放出する。この反応の正確な機構については未だ議論があるが、アポトソームはカスパーゼ-9の二量体化を誘導し、その後に自己触媒が行われることが示唆されている。活性化されたカスパーゼ-9はその後カスパーゼカスケードを刺激し、細胞をアポトーシスに従事させる。
選択的スプライシングによって、異なるアイソフォームをコードする7種類のバリアントが産生される。
構造
APAF1は6本のヘリックスからなるグリークキーモチーフを持つCARDドメイン、ロスマンフォールド型のヌクレオチド結合ドメイン、短いヘリカルモチーフ、ウィングドヘリックス（winged-helix）ドメインを含む。
相互作用
APAF1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
- APIP
- BCL2L1
- CASP9
- HSPA4
- NLRP1
出典
関連文献
外部リンク
- Human APAF1 genome location and APAF1 gene details page in the UCSC Genome Browser.
- Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: O14727 (Apoptotic protease-activating factor 1) at the PDBe-KB.
